EVENTO
Análise do Impacto do Polimorfismo Genético do Subtipo C do HIV-1 na Interação da Protease Viral com o Inibidor Nelfinavir por Modelagem e Dinâmica Molecular
Tipo de evento: Defesa de Dissertação de Mestrado
O grande problema no uso dos inibidores de protease (IP) para o tratamento anti-retroviral (ARV) é o aparecimento de resistência, resultado do surgimento de diversas mutações dentro do gene viral da protease (PR). Nos pacientes onde falha o tratamento com o inibidor nelfinavir (NFV), a mutação D30N é freqüentemente observada. No entanto, há diferentes subtipos virais e não está claro como essa mutação afeta cada um deles. No presente trabalho analisamos a ligação do NFV e do substrato CA/p2 com a PR dos subtipos B e C. As proteases selvagens e as mutantes foram investigadas em ambos os subtipos por simulações de dinâmica molecular (DM). As análises nos remetem a conclusão de que a mutação D30N parece facilitar a mudança conformacional na PR do subtipo B, mas não no subtipo C, e isto pode estar associado a uma desestabilização na região de α-hélice e a uma maior mobilidade na região das alças na PR do mutante B. Além disso, nas simulações DM observamos que as PRs mutantes apresentaram uma diminuição nos contatos intermoleculares. Estes resultados provêem importantes informações sobre o efeito da mutação D30N nas estruturas dos subtipos B e C, bem como na sua interação com o substrato e com o inibidor. Tais dados corroboram e explicam, ao menos em parte, o porquê da menor ocorrência da mutação D30N no subtipo C.
Data Início: 28/11/2008 Hora: 15:00 Data Fim: 28/11/2008 Hora: 17:30
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Auditorio B
Aluno: Rosemberg de Oliveira Soares - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Orientador: Laurent Emmanuel Dardenne - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Marcelo A. Soares - UFRJ - UFRJ
Participante Banca Examinadora: Carlos Frederico Fontes - Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ Laurent Emmanuel Dardenne - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Marcelo A. Soares - UFRJ - UFRJ Pedro Geraldo Pascutti - Universidade Federal do Rio de Janeiro - IBCCF/UFRJ Ricardo Bicca de Alencastro - IQ/UFRJ - IQ/UFRJ
Suplente Banca Examinadora: Ernesto Raul Caffarena - PROCC - FIOCRUZ/RJ Helio José Corrêa Barbosa - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC/MCTI
